王直逃走後，並不甘願就此失敗，而是怒火燒得更旺，伺機複仇。他回到日本後，又勾結各島的倭寇，並糾合了大量的海盜，浩浩蕩蕩地進犯江浙一帶。濱海地區再次告警。
    在海鹽，這裏打響海鹽守衛戰。嘉靖三十二年（1553年）五月，浙江海鹽縣遭到約七百多名倭寇的圍攻。海鹽縣令鄭茂等堅守待援，王忬調參將湯克寬前往海鹽支援。湯克寬便率三百多名士兵趕到，在城下與倭寇大戰，城內的明軍也殺出，內外夾攻倭寇，當即斬殺倭寇四十多人，倭寇見勢不妙，倉皇逃走。
    但是倭寇並沒用放棄進攻海鹽的計劃，逃走後請求增援去了。僅過了三天，就有約四千名倭寇再次來到海鹽城下，企圖一舉攻下海鹽城。而海鹽城內守軍僅兩千餘人，但並不畏懼，湯克寬率領將士們全力以赴守城，同時發動百姓積極參戰，百姓們踴躍參與，就連婦女都幫忙搬運石頭、提供糧食，大家同仇敵愾。倭寇用雲梯一次次想要爬上城牆，但一次次被軍民用石頭砸死，或被弓箭射死，或被掀翻雲梯摔死。見登城不行，倭寇轉而集中兵力攻打城門，又被軍民齊心協力擊退。
    不料，天空下起傾盆大雨，導致有一段城牆坍塌。倭寇蜂擁而至，有的已經進入城內。情況萬分緊急，就在這時，湯克寬率領軍兵與倭寇大戰，殺死進入城內和正在爬牆的倭寇，然後命令部下立即修整城牆，情況終於得到好轉。倭寇連續攻了三天，丟下無數的屍體，但就是攻不進去，隻好退去。明軍在海鹽守衛戰取得勝利，這也體現出軍民眾誌成城的威力巨大。
    在普陀山（今浙江舟山普陀山），這裏也打響激烈的戰鬥。嘉靖三十二年（1553年）八月，倭寇蕭顯部的一股勢力本要逃回日本，但被俞大猷在海上攔截，倭寇退路受阻後被迫登上普陀山，挖壕溝自守。俞大猷率軍進攻，他的部將百戶鄧城、武舉火斌等率軍率先衝鋒，大軍隨後跟上廝殺。倭寇大敗，且戰且退，直至退到山頂。俞大猷指揮軍隊進行圍攻，殲敵數百人，但是並沒有擒獲頭領蕭顯。明軍奪得普陀山後，讓火斌率領三百人守島。沒料到，嘉靖三十三年（1554年）三月時，有新一批倭寇來到普陀山，火斌率領部眾殊死戰鬥，贏得首回合勝利。但就在此時，又有大批倭寇前來增援，而明軍未獲得增援，因此寡不敵眾，火斌及士兵三百人為國捐軀。為此，俞大猷受到戴罪立功的處分。
    嘉靖三十三年（1554年）三月，蕭顯引著倭寇大掠上海、平湖、海寧、臨平等地，氣焰囂張，為害尤烈，到處殺人放火，殘暴無極。盧鏜率軍進行抵抗，大敗蕭顯。蕭顯率殘部逃往浙東，盧鏜緊追不放，終於在慈溪將蕭顯斬殺，並全殲了該股倭寇，大快人心。同年四月，倭寇攻擊嘉興，兵巡副使陳宗夔率兵抗擊，打退了倭寇，並焚燒了倭寇的船隻，倭寇逃走。同年五月，倭寇來到嘉興石墩，盧鏜率指揮劉隆、潘鼎等大戰倭寇，斬殺倭寇三百多人。
    明軍雖然打了不少的勝仗，但也打了敗仗，損失不小。如盧鏜在海寧抗擊倭寇時，因內奸通敵，遇到倭寇伏兵，將士陣亡一千多人。都司周應禎在黃山嶺（在嘉興平湖）戰倭寇，中了埋伏，周應禎及部眾兩千多人陣亡。署都指揮僉事夏光在王江涇大戰倭寇，夏光中箭陣亡部下數百人為國捐軀。此外，嘉善被倭寇攻陷。
    總體而言，倭患依舊嚴重，形勢仍然十分嚴峻，正因如此，朝廷對王忬的表現仍然不滿意。其實這也不能全怪王忬，畢竟倭患是此前留下來的，積重難返，且王忬上任時間不長，才兩年，消滅倭寇尚需時日。但朝廷缺乏耐心，看到尚未全麵取勝，就想換人了。
    嘉靖三十三年（1554年）五月，朝廷做出人事變動的決定，讓南京兵部尚書張經負責討倭事宜，而調王忬到北方工作，進右副都禦史，巡撫大同，加兵部右侍郎。
    雖然王忬官職沒被降，但是他此後生涯十分淒慘。這裏順便交待一下。王忬和他的兒子王世貞得罪了嚴嵩。王忬收藏名畫《清明上河圖》，嚴嵩索要，王忬便將摹本送給嚴嵩，後來被裝裱匠認出是臨摹的，因此嚴嵩大恨王忬，尋機陷害。此外，忠臣楊繼盛因彈劾嚴嵩而被斬首後，王世貞幫忙辦理楊繼盛的喪事，被嚴嵩父子知道，又加了一道恨，尋機報複。嘉靖三十八年（1559年），俺答進犯潘家口長城（位於今河北寬城縣），灤河以西一帶州縣告急。王忬被禦史王漸、方輅彈劾失職之罪，開始是被皇帝問責，但方輅仍不罷休，繼續彈劾，列了若幹罪狀，於是朝廷把王忬逮捕到詔獄。王忬下獄後，王世貞和弟弟王世懋每天在嚴嵩家門口跪拜，哭著求情，嚴嵩假言安撫二人，但暗地裏卻將王忬往死裏整。王世貞兄弟還向其他權貴求援，但沒有結果。後來王忬被斬首。王世貞和王世懋相泣號慟，持喪而歸，令人感到可憐和感動。隆慶年間，王世貞和王世懋為父伸冤，王忬終於得到昭雪。