孝惠章皇后是顺治的第二位妻子。她小顺治三岁，在顺治十七岁时，先被聘为妃，后册封为皇后。此时，正处于顺治刚刚废掉先皇后博尔济特吉氏的紧张时期。而对于这样一位同出于博尔济吉特氏的新皇后，顺治依旧没有多少爱恋的感情。
    历史上对孝惠章皇后的脾气禀性并没有过多介绍，从顺治帝找不出废后的借口来分析，孝惠章皇后应该是个安静的女孩，但毫无个性可言，也就是说没有生活的趣味，更确切地讲，她还是个懵懂无知的少女，甚至说她还有点傻。而这时，顺治的生活中突然有了董鄂氏，于是满腔地热情就转移了方向，本来就对她冷淡的顺治，就再也没有一丝好感了；幸而孝惠章皇后从不管顺治与董鄂妃的亲密关系，从没有争风吃醋，反而安静地呆在自己的后宫，了度这青春如花的年华。直到董鄂妃染疾身亡，顺治变得郁郁寡欢，第二年便卧床不起，很快即随董鄂妃而去，死时才二十四岁。
    从此，废后新后，即大、小博尔济吉特氏，便开始双双守寡。可怜她们从未得到丈夫的关心，更在如花年纪丧夫守寡，从此独对清灯，无限凄凉。其中孝惠皇后活得很久，一直活到康熙五十六年才死，享年七十七岁。
    孝惠章皇后，博尔济吉特氏。出身科尔沁部左翼扎萨克(意为执政官)达尔汉巴图鲁亲王满珠习礼家族。
    顺治十年八月，世祖废元后博尔济吉特氏为静妃；十一年五月，选纳入宫，封为妃；六月，册为皇后。后与世祖感情不睦。
    顺治十三年八月，内大臣鄂硕女董鄂氏入宫，册为贤妃；十二月，晋董鄂贤妃为皇贵妃。此时，世祖欲再度废后改立董鄂氏，帝后关系又更加恶劣。
    顺治十五年正月，因太后不豫，世祖责后礼节疏阙，停用中宫笺表，下诸王大臣议论废后事宜；三月，因太后旨，事未成。
    顺治十七年八月，董鄂妃病故，追尊孝献皇后；十八年，世祖崩。
    顺治十八年，皇三子玄烨登基，是为康熙帝，尊后为母后皇太后，上尊号曰仁宪皇太后，居慈仁宫，后有抚康熙第五子胤祺于宫。
    康熙二年，康熙帝生母孝康章皇后崩。
    康熙二十六年，孝庄皇后崩。至孝庄崩前，康熙帝虽晨昏定省，但与嫡母仅保持官方关系，至孝庄崩，帝后母子恸甚，孝惠后哀哭不能起，康熙帝亦割辫哀痛以表孝思，此后，母子二人遂有更进一步接触。
    康熙二十八年，修建宁寿新宫，落成，康熙帝率诸王大臣请太后入居。
    康熙三十五年，康熙北巡，逢太后寿，奉书称祝，太后亦遣送衣裘，康熙帝虽因河未冰不能服，仍上书表示待天寒必欢喜服之，又遣送水果干并土产至宫中，令总管太监顾问行请太后尝鲜（事见懋勤殿收康熙帝家书）。
    康熙三十八年，帝南巡，奉太后同行。而后，太后六十寿、七十寿，康熙帝均亲制词赋并大礼以祝，然太后均以尚俭故，停宴饮。
    康熙五十二年，太后亲妹淑惠太妃亡故；时太后老迈，发苍齿摇，心中不乐，对康熙语曰“牙齿动摇，其已脱落者，则痛止，其未脱落者，痛难忍”，康熙则对曰“太后圣寿已逾七旬，孙及曾孙殆及百余，且太后之孙，皆已须发将白而牙齿将落矣，何况祖母享如此高年。我朝先辈，常言老人牙齿脱落，于子孙有益，此正太后慈闱福泽绵长之嘉兆也”，太后闻言欢喜倍常，笑曰“皇帝此语，凡我老妪辈，皆当闻之而生欢喜也！”（事见《康熙帝家训格言》）
    康熙五十六年十二月，太后病重，康熙帝亦因废太子事心力交瘁，头眩足肿不能行，仍以帕裹足至宁寿宫亲奉汤药，太后昏迷之际，康熙帝跪于床下，捧太后手呼曰“母后，臣在此”，太后闻言，张目而视，不能语，执帝手视之；丙戌，太后崩，康熙号恸欲绝，坚行割辫之礼(割辫原仅用于帝丧)以尽哀思，不亚于孝庄之亡；时有臣子迎上意，以孝康后升祔以久不宜迁动，而欲以孝惠后、孝康后神主并尊祔于庙，大学士王掞曰“陛下圣孝格天，曩时太皇太后祔庙，不以跻孝端上，今肯以孝康跻孝惠上乎？”，后康熙果斥之，令改正，以嫡母神主加于生母之上。
    孝惠后崩后，雍正及乾隆年间累加谥，曰孝惠仁宪端懿慈淑恭安纯德顺天翼圣章皇后。孝惠后葬于世祖孝陵之东，曰孝东陵，世祖、孝康后、孝献后（董鄂妃）同葬于孝陵，然康熙帝仅上章字于嫡母、生母，并称章皇后，同祔大庙，孝献后则仅能于孝陵祭祀，在康熙年间不知是否因顾虑孝惠后的缘故，于孝献后生辰祭日亦未派遣使节祭陵，孝惠后亡故后，此后诸帝亦未曾见遣使独祭孝献后。