嘉靖二十七年四月初五這一天剛剛入夜，朱紈下達了攻打雙嶼港的命令。一霎時，停泊在磐石衛港口的包括大福船、二號福船、草撇船、海滄船、開浪船、快船在內的四百八十艘大小戰船，載著六千多名官兵駛出港口，鼓風楊帆向著雙嶼港駛去。朱紈乘坐在雄獅號大型福船上指揮戰鬥。
    雙嶼港位於佛渡島和六橫島之間，在石柱頭山與邊浦嶴之間的北港水道與南港水道是倭寇船隻出沒的主要航道。要打下雙嶼港，必須首先控製雙嶼港的南北水道，將倭寇戰船消滅在雙嶼港內。為了有把握地打下雙嶼港，朱紈做了周密的部署。由盧鐺、魏一恭和劉恩至三人率領主力從正麵攻打雙嶼港，由福建巡海道副使柯喬、都指揮黎秀二人分別在雙嶼港外海域對倭寇進行攔截，防止倭寇從外海逃跑。
    朱紈命令參軍張四維率領十艘大型福船和其他戰船四十艘駛向佛渡島南麵的海域，參軍張漢率領十艘大型福船和其他戰船四十艘駛向六橫島北麵的海域，形成對雙嶼港倭寇的南北夾擊之勢。
    由於突然改變了風向，船隊的航行速度受到影響，但是戰船仍然在向著雙嶼港前進。
    雙嶼港已經隱隱約約出現在前麵，朱紈把千裏鏡貼近眼睛注意觀察著雙嶼港，此時雙嶼港似乎還安靜，朦朧的月色透過翻卷著的雲層投射在海麵，海風卷起巨浪撞擊在雙嶼島周圍陡峭的石壁上，發出令人恐怖的巨大聲響。但是聽不出雙嶼港有什麼異樣的動靜。然而就在此時，從雙嶼港傳來隱隱約約的喧鬧聲。朱紈判斷，雙嶼港已經發現了明軍的動態。
    雙嶼港確實已經發現了大明水師已經靠近了雙嶼港，消息傳開，雙嶼港三千多人高度緊張起來。由於日本的鬆浦隆信男、辛五郎、稽天新四郎、武藤源六郎、織田信義和中國的王直等人帶著六百名以日本人為主的隊伍去了永寧，雙嶼港的軍事實力已經大為減弱，明軍在這個時候來攻打雙嶼港，雙嶼港實在處於萬分危急之中。
    明軍大軍壓境，敢於拚死的日本人大部分走了，怎麼辦啊。雙嶼港的大多數人都失去了主見。緊急情況下，葡萄牙人何亞八和平托站出來了。何亞八和平托一生從事海外冒險活動，曾經走遍了印度的恒河流域，到過馬來西亞、菲律賓、文萊等東南亞國家，見過許多大世麵，此時突然遇到緊急情況，何亞八和平托比起中國的許棟和徐海等人就顯得比較有主見，何亞八大聲說：“都不要慌，如果這樣一團糟，隻怕明軍輕易就打進來了。這樣吧，立即將港口閘門緊緊關閉。明軍要打進來，唯一的路是港口前麵的一排水閘，關閉了閘門，憑著我們五十座佛郎機炮和兩千多支火槍，足可以抵抗幾天，等去永寧的六百人回來，我們來個裏外夾攻，不愁他姓朱的不滾回去，現在大家立即投入緊張的自衛戰鬥！”
    何亞八的話居然起了很大作用。許棟、失刺沙也門、嚴山佬、徐海、李光頭、高贈烏魯美他郎等倭寇頭領一齊動手，將港口大門外一排水閘關閉了，將用於海水漲潮時用來駕船出港的烏篷船吊上港口閘門的頂部，以防明軍突入港內。
    原來這港口水閘有三個作用，第一是，平日海水水位不高，水閘是開著的，當城門供人們出入；第二是，當海水漲潮的時候，關閉水閘，海潮就被擋在港口以外；第三是用於防禦敵人攻打港口。一旦發生強敵攻打港口，立即關閉水閘，六丈多高的水閘猶如一堵高高的城牆，敵人是無法通過水閘打入港口內部的。而港口周圍其他地方都有沿著海灘陡壁修築的石牆。海島上的礁石非常豐富，在海島上，礁石就是最好的建築材料，雙嶼港一千座座房屋都是用礁石堆碼修建而成的石頭屋。
    在雙嶼港的大小頭領帶領下，在很短的時間內已經把港內的五十座佛郎機炮擺放在最便於攻擊的發射位置，兩千多名戰鬥人員全都荷槍實彈等待著明軍來攻打。
    再說明軍方麵，各種戰船已經到達雙嶼港附近海域。由於朱紈並不了解雙嶼港的布防情況，對部隊攻入雙嶼港後兵力如何展開沒有把握，於是朱紈命令盧鐺首先做試探性的進攻，以弄清倭寇的兵力部署和武器配置等情況。於是盧鐺開始對雙嶼港各個部位進行了第一輪轟炸，果然，倭寇的五十座佛郎機炮一齊向明軍戰船開炮還擊。盧鐺還派一個小隊試圖從港口攻入，但是盧鐺得到的報告是從港口根本不可能攻入港內。
    盧鐺向朱紈作了彙報。經過一番琢磨，朱紈給盧鐺下達命令：暫緩進攻，將雙嶼港團團圍住，以觀其變。於是盧鐺作出部署，大型福船與其他各類戰船互相交替著排列，把雙嶼港西北部的六橫島和東南部的佛渡島沿海域的北港水道與南港水道嚴密封鎖起來，不讓任何船隻駛出雙嶼港。
    天亮後，朱紈來到雄獅號大福船的頂層甲板上，他要對雙嶼港做近距離的觀察。朱紈把千裏鏡貼近眼睛，雙嶼港內的情況清清楚楚出現在麵前：整個的雙嶼港就是一座中等城市，鱗次櫛比的房舍構成一個巨大的建築群，其中包括教堂、醫院、仁慈堂等西方建築。朱紈憑著千裏鏡的遠視功能，還可以清清楚楚地看到許多不同國家的人。由於朱紈曾經在京師度過一段時間，從膚色、穿著等方麵可以辨別是那個國家的人。此時朱紈看到雙嶼港不但有中國人、日本人和葡萄牙人，還有馬來西亞、占城、暹羅、婆羅洲等國的人。朱紈現在才知道，所謂的倭寇，不僅僅是日本的海盜，還包括中國的、葡萄牙的和許多南洋國家的人。怪不得一個雙嶼港能夠聚集起如此強大的經濟實力和軍事實力。
    朱紈想看看雙嶼港的軍事設施，但是通過反複搜尋，僅僅隻發現幾處可疑點，在石壁上鑽有小洞，朱紈估計那小洞很可能是用於發射的炮眼和槍眼。朱紈發現，在有利防守的幾處都修築有鑽有小洞的牆壁，牆壁都是用石塊砌成。看來這雙嶼港的軍事設施還不錯，要強攻雙嶼港，一定要付出沉重的代價，甚至還有攻不進去的可能。
    於是朱紈開始考慮智取。朱紈冥思苦想，怎麼樣智取呢？朱紈等軍事高層人物中沒聽說有誰跟雙嶼港的上層人物有什麼關係，現在港口水閘緊緊關閉著，要派小分隊混進雙嶼港幾乎是不可能的。朱紈想啊想，但是就是想不出什麼辦法。
    就在朱紈苦思冥想想不出妙計的時候，海麵上忽然駛來一隻船，很快，那隻船被盧鐺的“雄鷹”號大型福船截住，船上包括水手在內共十二個人被抓住。經審訊，這十二個人異口同聲地一致承認他們都是雙嶼港的普通居民，在半個月前去了鬆門嶼，今天才趕回來。盧鐺立即帶著這十二個人來麵見朱紈，朱紈簡單地詢問了情況。對於這十二人到底是什麼人，朱紈不怎麼想知道，因為朱紈知道，這些長期在雙嶼港冒險的人不會有實話告訴你的，但是朱紈從這十二個人的行蹤產生了一個想法。朱紈輕描淡寫地詢問了一些情況，要盧鐺把十二個人放了。
    盧鐺將十二個人放回他們的船上，返回朱紈所在的船艙，問：“提督大人為什麼把這些人放回去呢？難道不想從他們身上得到一些有用的東西嗎？”
    朱紈笑笑說：“已經得到有用的東西了。”朱紈輕聲對盧鐺說出一番話，如此，如此，如此。
    朱紈的水師在雙嶼港周圍的六橫島、佛渡島和北港水道與南港水道上選地方隱蔽起來。一天一夜過去了，一個新的黎明來到。雙嶼港三千多人又在惶恐中度過了一天一夜。由於明軍沒有動靜，雙嶼港的人似乎鬆了一口氣。這時候海上起了大霧，大霧籠罩著雙嶼港以及周圍的島嶼和大大小小的礁石群。接著就下起了大雨，狂風巨浪在海天之間轟鳴。一時間，雙嶼港及其周圍的大小島嶼都籠罩在雨霧之中。
    雖然明軍沒有動靜，但是雙嶼港的人並不感到危險已經過去。他們清楚，既然姓朱的已經把大軍帶到了雙嶼港附近，姓朱的不會輕易罷手。至於什麼時候姓朱的再開打，雙嶼港則無法知道。
    圍繞著怎麼樣對付明軍，雙嶼港的高層決策者一整天都在討論。半日時分，從鬆門嶼回來的十二個人回來了。何亞八、許棟、失刺沙也門、徐海、李光頭等倭寇頭領聽說毛海峰帶去的十二個人從鬆門嶼回來了，大感奇怪，當即對毛海峰進行審訊：
    “小毛，你們回來還順利吧？”許棟試探著問。
    “還算順利。最近雙嶼港沒有出什麼事吧？”
    “天都快要塌下了，還沒有出什麼事？”
    毛海峰故作驚訝：“怎麼回事？是不是明軍有什麼動作？”
    “毛海峰，我要你詳細說說你們是怎麼樣回到雙嶼港的，有沒有碰到過明軍的戰船，有沒有被明軍抓住過。”許棟說。
    “許叔叔，你這話是什麼意思？我要是碰到過明軍的戰船，我們還能回到雙嶼港嗎？我要是被明軍抓住過，我毛海峰還有命嗎？”
    “明軍大軍壓境，雙嶼港已經被明軍團團包圍，說你們能夠順利進入雙嶼港，鬼才相信呢。毛海峰，你必須說清楚，你們到底是怎麼樣回到雙嶼港的。這個事情不說清楚，雙嶼港可不敢輕易收留你們。”
    毛海峰氣急敗壞，大聲吼道：“姓許的，你要乘著我義父不在就要趕我走嗎？沒門！懷疑我毛海峰作了明軍的奸細，我毛海峰還說你許棟是明軍的奸細呢。今天我倒要看看，你姓許的怎麼樣把我趕出雙嶼港！”
    徐海看到毛海峰發脾氣了，打圓場說：“毛侄兒，你許叔叔也不是說你是明軍的奸細，隻因目前局勢緊張，昨天晚上明軍大部隊已經來攻打雙嶼港了，還是我們進行了堅決抵抗，明軍沒有打進來。我們懷疑明軍已經對雙嶼港實行了包圍，所以你許叔叔怕你們……”
    “原來是這樣，是我對不起許叔叔了。不過我們真的沒有碰到明軍的戰船，也許今天天氣不利於戰鬥，明軍已經撤回了。”
    開始，許棟和徐海等人懷疑毛海峰被明軍俘虜過，已經與明軍串通，前來說服許棟和徐海等人向明軍投降，或者是使用奸計奇襲雙嶼港。可是聽了毛海峰的一番話，相信毛海峰確實是平安回到了雙嶼港。由於毛海峰的特殊地位，雙嶼港眾多頭領都不敢對毛海峰的話提出質疑。實際上，朱紈和盧鐺都沒有為難毛海峰，把毛海峰等人作為雙嶼港的守法居民放回雙嶼港。於是毛海峰把被明軍抓住的情況隱瞞起來。毛海峰最後那句話“也許今天天氣不利於戰鬥，明軍已經撤回了”居然提醒了許棟：是啊，今天天氣如此惡劣，明軍應該撤回了。但是明軍絕不會輕易放過我們，不如……
    於是許棟大聲說：“各位，我看是這樣，從毛海峰等十二人能夠順利回到雙嶼港，說明明軍已經不在雙嶼港附近了。今天天氣惡劣，不利於戰鬥，明軍一定撤回了。但是我認為明軍不會輕易放過我們，惡劣天氣過後，明軍一定再來攻打。是不是這樣，我們今天晚上就撤出雙嶼港，去鬆門嶼那邊暫避，等去永寧的六百多人回來，我們再回雙嶼港，大家看怎麼樣？”
    許棟的提議得到大家都讚同。