自然係的惡魔果實可以讓身體變成自然物質（或現象）、讓物理攻擊無效等等。自然係被公認為三種裏最強的一種。雖然近乎無敵，不過隻要找對方法，仍然能夠擊敗能力者。
    名稱能力者出處能力備注
    冒煙果實-白獵人斯摩格100可以變成煙霧，煙霧能實體化、困住敵人等等克火，威力效果較弱
    火焰果實-火拳波特卡斯·D·艾斯159可以變成火，施放火炎網、火拳攻擊等等碰到水會熄滅，就無法抵擋物理攻擊
    沙礫果實-沙鱷魚克洛克達爾170可以變成沙的能力，右手能吸幹所接觸人或物品的水份、產生沙暴、讓岩石、土壤變成沙等等碰到水會實體化（結塊），就無法抵擋物理攻擊
    水濤果實-紅心皇後（劇場版）發條島大冒險可以讓身體變成液態，能鑽入任何細縫，產生大波浪因水是導電體的緣故容易觸電，也怕被密封到容器裏
    軟糖果實-嘉斯帕德（劇場版）死亡盡頭大冒險可以讓身體變成像綠色軟糖一樣，使敵人的武器或拳頭黏在體內，全身也能變成尖銳狀物體碰到小麥粉會實體化（結塊），就無法抵擋物理攻擊
    轟雷果實-神艾涅爾274可以變成雷電，放電攻擊，產生電能驅動機器，或借由放電作用產生高溫對絕緣體（如：橡皮人）沒有效果
    冷凍果實-海軍本部大將青雉319可以冰封所有接觸到的事物，包括將部份海麵冰凍以方便在上麵騎腳踏車，被冰凍住的人或生物會呈現假死狀態，如果身體碎掉就會死亡被帶熱的物體或火焰擊中就無法抵擋
    黑暗果實-黑胡子馬歇爾·D·汀奇440擁有“異暗”的引力。當身體變化成“黑暗”時，可以將一切與“黑暗”接觸的事物吸入，壓縮，及粉碎。並且擁有隔空吸引能力者，以及憑接觸使能力者（不論係種）暫時失去能力的能力（例如：打擊的到自然係的能力者）因為本身是“引力”的關係，此能力者“吸收”到的傷害比平常人還要多，受到的“痛苦”相對的也較多，也就是說無法借由本身性質的改變來躲避物理攻擊。
    閃光果實-海軍本部大將黃猿511可以變成光，踢出光速般的重擊，也擁有光速般的速度，手指可發出光線，若射入敵人眼睛將導致暫時性眼盲。因為可以射出光線，碰到鏡子及玻璃會折射。（例如：黃猿的八呎鏡）
    毒毒果實-深海監獄獄長毒龍-麥哲倫能將身體化為毒液毒龍接觸者會感受地獄般的痛苦煎熬致死暫時無敵僅解毒藥和治療荷爾蒙有醫治中毒者的效果麥哲倫本人由於和毒湯以毒攻毒經常腹瀉。。。