却说朱纨回到州府自己的官邸，只见一位官员已经在大门口等着，原来是项乔。朱纨带着项乔进入府邸客厅，问：“写好了？”项乔从衣袋里摸出一叠稿纸递给朱纨，说：“请朱提督过目。”朱纨接过稿纸，看到题目是《呈朱提督关于海防事》。朱纨看正文：
    “本职温州滨海人也，祖居离海不过两三箭，尝亲见海贼之杀人，思欲食其肉而寝其皮，而恨于力之不逮也。今以温州一府推之，四三年来，每遇八月以后，十一月以前，巨室揭家以逃生，细民执殳以待命，黑夜惊呼而逾垣出走，官军屯堵而鸡公狗骚然，何异北虏防狄之苦也。往岁贼人檄取高商书银数千两，南屏先生避居温城凡数月，日闻顾秋山都宪在县治，亦几不免于贼矣。在温州，连高友玑、顾遂等高官也自身难保，何况普通百姓，足见当时海患之严重。但项乔认为，近有戗官军者，此皆海禁不通之故也。海通，则舟人籍名官府，家家各有所顾忌，而不敢掳掠，既有掳掠者，严地方交通接买之禁，坐舟人擒之，不劳遗力矣。加强管理和解除海禁并举才是正解。
    闽浙海盗，其大有二：其在外也，岛夷窃发，漳人乘间，是之为寇；其在内也，弗靖之民，实阴主之，是之谓奸。御寇以兵，御奸以法，此古今不易之论也。谨献为兵之术六，为法之术五。
    兵之术者，整饬军队，加强海防也。以前观之，闽浙两省军务分治，每当海域有事，则往往两省官兵消极应付，互相推诿：浙有寇，浙之海道驱之而入闽，曰：吾地方宁矣。虽闽寇之如水益深，不复能顾也。闽有寇，闽之海道驱之而入浙，曰：吾地方宁矣。虽浙寇之如火益热，不复能顾也。故专任以责成功，两省各敕海道宪臣以专备海寇，使能各尽其术。萃其涣而统一之也。且居柯于漳，居沈于温，由朱纨遥制。
    法之术有五：一曰重保甲之令。夫倭寇、番夷、佛郎机等贼，倚海为窟，出没不时，诚难底诘。然此等非漳、皋之民，虽不禁止，而亦不来矣，漳、皋之民，非能家于海也。孰无父母兄弟，孰无妻子？必有出门之期，还家之日也。二曰申私船之禁。禁私造二桅海船。此大舟者，装载之富，既足以致倭兵甲之利又足以为寇矣。三曰难于戢党羽。往者海上虽多盗，然惟攘取钱谷与货贿而已，今则鱼盐刍藁亦为一空，以吾民为之易贸故也。向也取其舟所有而已，今则质其主而归其仆，非尽其家之所有，不得生焉。且一见之顷，如指故知，曰某也富，某也贵游，某也赎千贯，某也赎百贯，必盈其欲而后已。不如其限，不盈其欲者，辄腰斩以示众，以吾民为之指示故也。向也止凭舟为险而已，今则数百成群，登岸以杀人越货矣。四曰搜捕奸豪，公于御强御。盖此通番窝主协济之家，类皆豪右之族，其势足以弭其乡曲，其财足以略其里胥，是以匿而不发，发而不坐也。甚者，高树旗幡，明揭姓氏者，往捕者睥睨其下，莫敢谁何！此又无忌惮之尤者也，执而来，必置之法。五曰恕以待胁从。滨海渔樵之家，为贼所质以索赎，必协之以行动。被获于官兵者，又即以贼绳之，间有逃归半路，官兵即取首级献功，冤也久矣……”
    “好啊，你跟我想到一处了。要根除倭患，必须从整饬军队，加强海防着手，加之以整饬法制。好吧，我们现在就从这些方面动起来。”朱提督说。项乔高兴了，自己的想法终于可以付诸实现了。
    朱纨送走项乔后，开始着手考虑具体工作。从项乔的文章可以看出，沿海倭患确实到了非常严重的程度。别说普通百姓受害不浅，就是蒙受皇恩的高官和商贾巨富也深受其害。如果不从根本上彻底铲除倭患，让其蔓延，可能导致大明天下的动摇。
    朱纨从项乔的文章受到启发，倭寇群体并不仅仅是外来的日本海盗，还包括大明官民中一部分为牟取暴利而铤而走险的亡命之徒。项乔指出，“寇”与“奸”是“倭寇”形成的两个方面，但是两个方面的从属是不同的，因而治理的方法也不同。对付“寇”，靠的是武装力量；对付“奸”，那就得靠法制了。武装力量与法制相结合，才能从根本上彻底铲除倭患。
    有了这个思路，朱纨的工作开始有了头绪。朱纨草拟了一个工作计划。主要内容有：
    首先要做的是对闽浙两省的卫所进行整饬。长久以来，卫所官兵管理不统一，闽浙两省的卫所各自为政，没有形成统一力量，导致战斗力不强，而且由于没有统一指挥，倭寇有空子可钻，这里遇到抵抗，形势不利，可以转到他处抢掠。沿海地域广大，回旋余地也很大，倭寇因此敢于肆意妄为。再者，一部分卫所官员德行堕落，为满足私欲不惜徇情枉法，放纵或者与倭寇暗自串通，对地方进行大肆抢掠。如嘉靖八年，盘石卫指挥梅毕、姚英、张鸾等守黄华寨，受牙行贿，居然允许私船入海为盗，进行非法交易，抢掠地方，这种恶劣事件必须杜绝。
    整饬卫所还包括对官员的任用。要把那些德行高尚、能力突出的军官安排在紧要地方。目前要做的是将福建巡海道副使柯乔调往漳州，将福建都司都指挥卢镗调往温州。以后根据具体情况随时对官员进行调动。
    第二件事是大力加强海防。自洪武皇帝以来，闽浙两省在加强海防方面做了大量的工作。自明初起，苏松常沿海就设有专门防御倭寇的军备。当时松江府沿海防守之处，起自吴淞，经过川沙、南汇、青村、柘林而到达西部的金山卫卫城，金山卫成为防倭重镇。金山卫北是太仓卫，西是海宁卫，当年倭寇侵扰苏松常地区的军事行动，大多在长江口的太仓和杭州湾北的金山一带登岸。金山卫卫城是保卫京城南京的屏障。温州作为闽浙两省的交汇点，又加上温州海岸有许多天然良港，于是温州成为倭寇侵扰的重点区域。为了有效地预防倭寇侵扰，明太祖下令在温州府城设立了温州卫，下辖前、后、左、右、中五个千户所。洪武五年，温州卫设沿海巡检司十处，管辖九十三处烽堠。建梅头巡检司城。朝廷将温州等地六百六十艘海船改造成多橹快船，用于抗倭。洪武皇帝还诏命温州海上大量造船以抵御寇。洪武六年，为防卫抵御倭寇侵扰，兴建乐清县新城。洪武七年，为防卫抵御倭寇侵扰，平阳守御千户缪美增筑平阳城。洪武十七年至洪武二十年，为防御抗击倭寇侵犯，信国公汤和奉命巡视浙江沿海诸郡，整饬海防，于沿海建卫城。浙南温、台地区防御倭寇的军事设施建设得到高度重视和加强。温州府作为抗倭重镇，汤和命温州卫指挥使王铭修缮整治了温州府城，增筑外垣，疏浚城壕，同时在温州地区设置温州卫、磐石卫、金乡卫三个卫，设指挥使司。目前要抓紧做的是鹗渚堡和张岭堡的修筑。
    加强海防需要足够数量的兵员和先进的武器装备。沿海设立的巡检司原定兵额是二千五百人，现在绝大多数只有千人左右，有的甚至被撤销。不仅人员减少严重，武器的数量和质量也大不如从前。以海防中最重要的战船为例，数量只有鼎盛时期郑和下西洋的十分之一，而且战斗力最强的大型战船全部损毁。由于水师战斗力不强，所以从来不敢干涉海上的走私贸易，一部分水师头领甚至和海商集团一起进行非法交易，从中渔利。要扭转这种现象，必须迅速想办法增加兵员，可以从内地调动部队进入沿海，充实卫所兵员。或者从沿海地区招募壮丁。要赶制出一批装备先进的大型战舰装备沿海水师。
    加强海防需要足够数量的战船。为了应急，首先征调战船四十余艘，分布在沿海各港口，做好随时投入战斗的准备。
    加强海防需要沿海的乡民大力支持。为了应对卫所兵力的不足，可以从沿海地区招募乡勇组成自卫军，进行军事训练，当出现倭情时配合卫所官兵参加战斗。
    粮食供应是军队战斗力的保障，要特别抓紧粮食的储藏。要对各卫所屯粮数规定储藏量，还没有达到储藏量的，由海道副使限期完成。
    第三件要做的事情是禁止商船下海。为什么要禁止商船下海呢？实际上，本朝自洪武皇帝以来一直实行海禁，禁止商船下海。根源在于倭寇。元末明初，日本的幕府和大名互相征战。在战争中失败了的幕府和大名，为了寻找出路，就组织武士、商人和浪人到中国沿海地区进行武装走私和抢掠骚扰。这些武士、商人和浪人就被中国东南沿海的人们称作倭寇。洪武年间，为了防止倭寇侵扰，下令实施海禁政策，禁止中国人赴海外经商，也限制外国商人到中国进行贸易。随着倭患越来越严重，海禁政策也愈加严格。目前东南沿海的倭患已经到了非常严重的程度，所以强化海禁政策也是目前抗倭战争的需要。
    第四件要做的是完善里甲制度。早在洪武年间，皇帝就制定一百一十户为一里的规定，在全国推行黄册制度，完善地方的管理机构，规范地方社会的权力结构，形成以安分守法的地主富民为乡村社区管理层的社会秩序。但是由于人口数量的增长和迁移率的提高，乡村社区成员之间贫富分化程度的加剧，商品经济发展对乡村社会的冲击和影响等原因，建立在里甲体制上的原有乡村社区呈现出明显的分解趋势，粮长、里长之类的职役性地方精英的社会地位大幅衰落，乡村社会的支配权力转移到绅士和土豪等非职役性地方精英手中。所以在许多地方，里甲制度已经名存实亡。为了更加有效地进行抗倭战争，必须把广大乡村的人们都纳入有组织的轨道，这就必须把里甲知道恢复和强化起来。
    推行里甲制度，里甲的管理者可以组织本里甲的百姓行动起来，搜捕、严惩勾结倭寇的内贼，孤立倭寇。
    朱纨针对目前最要紧的几个问题进行专项整治，在各府州县贴出告示：
    “浙江巡抚、闽浙海防军务提督晓喻闽浙各府州县军民人等：为整顿海防，杜绝倭寇行动之便利，本提督特作如下规定：
    严禁专造违式大船，假以渡船为名，专运贼赃并违禁货物，以致不惜名检，招亡纳叛，广布爪牙，武断乡曲。下海通番之人，借其资本，籍其人船，动辄以某府自称，出入无忌，船货回还，先除原借本利相对，其余赃物平分，盖不止一年，亦不止一家。因此情由，不禁乡官之渡船，则海道不可清也。今本提督不恤怨谤，行令禁革，以清弊端：闽浙沿海，凡能远航之二桅大船须于十五日内至官府登记，由官府集中管理，然后由官府出资购买。另，未违禁船只虽被允许在海上从事正常贸易活动，但绝不允许假借乡官之名出入，并且接受官府的统一管制调用。
    倭寇、番夷、佛郎机等贼倚海为窟，出没不时，诚难底诘，然此等非籍漳泉之民，虽不禁之而亦不来矣。而愚下之民，一叶之艇，送一瓜，运一罇，率得厚礼。因此不严海滨之保甲，则海防不可复业。今本提督令：在漳州、泉州、兴化、福州四地强化保甲，将原不在保甲内的官吏、生儒、军匠等皆编入保甲，有不从而肆意抵触者，则首先予以劝谕，促使改过，再不从则送官惩治。通同不举者，十家连坐以罪。
    倭患根深蒂固，除日本和佛朗机海盗，大明非法商贾，闽浙沿海地区一部分无业者也参与非法经营之中，对倭患起着推波助澜的作用。自今日始，对闽浙私商下海百姓，先之以不追即往，继之以赏罚利害，凡在约束中者，即为良民，旧犯过恶，一切不稳，许其自新；有居民有素与番人通者，皆得自首相告；对不愿改过自新，仍与官府巧与周旋者，一旦捕获，以倭寇论处。
    朱纨做出部署，下达文件到闽浙各府、州、县，要求各府、州、县严格执行。一个以整饬卫所、加强海防、强化海禁、完善里甲制度的防倭抗倭运动在闽浙两省轰轰烈烈地开展起来。