第二天恭親王奕䜣以欽差大臣的身份約見日方談判代表，正式開始談判。經過三輪談判，雙方達成協議：1。大清帝國允許日本援華派遣軍入境。2。日軍總兵力不得超過三萬人。3。日軍的一切軍需由日本國負責。4。兩軍在合作過程中保持相對獨立的的狀態，戰鬥中情報共享，互相支援4。在大清帝國要求日軍撤出時，日軍必須無條件撤出。。協議達成後，光緒帝在協議上加蓋玉璽，批準了這份協議。就在同一天，日本明治天皇也在東京召開禦前會議，批準了這份協議，兩國正式開始合作。幾天後，日本援華派遣軍司令長官山縣有朋和參謀長水木長田來到金陵，山平修德約見恭親王奕䜣，請求皇帝召見山縣有朋和水木長田。恭親王報告皇帝，皇帝傳旨次日召見。
    第二天山縣有朋和水木長田在山平修德陪同下來到兩江總督府大門外，一個衛兵來到山縣有朋麵前：“將軍閣下，請下馬，交出武器。”山平修德把衛兵的話翻譯成日語，山縣有朋聽後翻身下馬，交出了自己的配槍和軍刀，水木長田也交出了武器，他們在衛兵的帶領下向大堂走去。在通往大堂的路上，山縣有朋看到夾道列隊的清政府禁衛軍仍然身穿鎧甲，手持長矛，腰佩短刀，忍不住暗暗歎了一口氣，這時一個太監喊道：“皇上口諭，宣山平修德、山縣有朋、水木長田見駕！”三個人來到大堂上，向光緒帝行跪拜禮，光緒帝下令給他們看座。然後說道：“朕謹代表大清帝國全體臣民對山縣將軍的到來表示歡迎。”山縣有朋起立回答：“多謝陛下，希望我們能夠團結一致共同禦敵。”隨後他讓水木長田介紹日本援華派遣軍的情況，水木長田從公文包裏拿出一份文件，開始宣讀：“日本援華派遣軍下轄四個步兵聯隊（步兵團）兩個炮兵聯隊，一個輜重聯隊（輜重團），兩個戰車大隊（坦克營），及一個戰地醫院。總兵力兩萬人……”宣讀完畢之後，清政府總理江防（長江防務）事務大臣袁世凱提問：“山縣將軍，貴軍什麼時候可以參加戰鬥？”山縣有朋答：“我軍一個月之內，可以全部到達戰場，投入戰鬥。請貴軍為我們指定登陸地點和駐紮地點。”光緒帝說：“貴軍登陸和駐紮的問題由袁愛卿（袁世凱）負責。賜山縣將軍禦宴一桌，恭親王陪宴。”
    預知後事如何，且看下回分解。