已經淡出銀河帝國政治舞台長達一萬多年的軒轅家族，早已被許多人遺忘。曾經的對手、現在的帝國統治者腓特烈家族在設計毀滅了軒轅家族後，這個輝煌的家族所剩的精英已經寥寥無幾。他們在銀河係中躲避搜捕他們的死亡軍團，最終逃亡到了他們認為安全的仙女星係。他們不敢與仙女星係的文明貿然接觸，因此長年躲藏在仙女星係邊緣區域中人跡罕至的小行星帶裏。他們沒有想到的是，腓特烈家族瘋狂的戰鬥欲望拖著整個銀河帝國開始了對仙女星係的戰爭。不久他們便被死亡軍團抓住，準備押送回銀河。如果不是被星辰官解救，他們此時已經落入腓特烈家族的手中。
    在被星辰官解救的四位軒轅家族子弟裏，軒轅宇是四人中年齡最大的一個。他是軒轅家族首領軒轅亮第二個兒子軒轅淩的後代，他還有一個哥哥軒轅徹。在家族鼎盛時期，父親軒轅淩任銀河帝國內政部長，哥哥任帝國武裝力量後勤部部長，權勢浩大，他因此也是帝國內部人盡皆知的明星人物。在腓特烈家族發動政變之際，在外帶兵的他接到哥哥冒死發出的急報：千萬勿回。這才躲過腓特烈家族的謀殺。他帶著堂弟軒轅斌、軒轅旭和軒轅晨暉，一路出逃到了仙女星係的梅林扇區，內心滿是深仇大恨。身為軍事經驗豐富、帶兵一流、自身擁有強大技能的銀河帝國統帥，一直希望有朝一日能夠反擊黑暗銀河。
    在銀河帝國過去數萬年裏，由於戰爭的刺激，很多遺忘了戰爭的文明重新被喚醒了關於戰爭的記憶，無數的智能文明湧現出了無數的各具自身特色的戰士和武裝力量。為了各個擊破敵軍，徹底了解敵人的特性，人類在軒轅家族的建議下，將所有文明的戰士或者軍隊歸為幾個類型。擅於使用機械機器的戰士屬於機械類戰士，擅於利用自身進化而變強的戰士屬於基因類戰士，擅於使用物理化學物質產生能量攻擊的戰士屬於能量型戰士，擅於使用精神力控製進行攻擊的屬於精神力戰士。在人類統一銀河的戰爭中，唯獨精神力戰士接觸得少之又少。軒轅宇深知人類缺乏對精神力文明的了解，而曾經接觸過的銀河係精神文明靠近仙女星係，顯然是仙女星係的古老移民。為了複仇，軒轅宇率領自己的弟弟們逃到了仙女星係，就是為了了解精神力控製的奧秘。現在，他們被仙女星係的精神力文明所解救，而這些長年生活在和平中的種族缺少的正是他們的戰爭經驗和指揮才能，軒轅宇自然向他們提出平等的交易——軒轅族人可以教授仙女星係梅林扇區的聯合軍戰爭技巧，而梅林扇區必須教授軒轅族人關於精神力控製的知識。
    星辰官認識到這是一個非常平等的交易。他隨即將斥候部隊的指揮權交給了軒轅宇，自己同時傳授精神力文明的各種知識給四個銀河係人類。在軒轅宇的指揮下，星辰官的斥候部隊神出鬼沒，經常襲擊死亡軍團的後勤運輸部隊或者斥候，這引起了死亡軍團前線部隊的注意，卻沒有完全重視。直到有一次，軒轅宇指揮仙女係人攻擊了以凶猛著稱的銀河係基庫爾雇傭兵守衛的能源補給站，造成死亡軍團整整有十萬人陷入沒有任何能源補給的危險境地，而基庫爾雇傭兵也全部陣亡(經死亡軍團調查發現是死於自相殘殺)，死亡軍團才將這一情況上報給最高統帥部。在令人聞之色變的死亡軍團內部，居然開始流傳起關於軒轅宇指揮的這支仙女係軍隊的傳聞，甚至很多死亡軍團的成員稱呼他的這支軍隊為幽靈。
    看到自己的斥候部隊在軒轅宇的指揮下發揮出如此強大的戰鬥力，星辰官完全折服了。他開始傾其所能教導軒轅宇等人如何開發精神力。由於人類的大腦開發尚未及克羅諾人的萬分之一，星辰官教導起來十分費勁。軒轅宇、軒轅斌、軒轅旭和軒轅晨暉無一例外都陷入了修煉精神控製力的瓶頸。
    在距離梅林扇區聯合軍總部100萬光年的死亡軍團最高統帥部，瘋狂的科勒·刀鋒已經覺得他的前線指揮官們都是飯桶。這位身高6米、能夠分裂出上百個本體的不死戰士，此時感覺到這次襲擊他的敵軍戰術十分熟悉。仙女星係的人不會有這種純熟的戰術思維，他們連正規軍都沒有，怎麼可能發動這麼詭異的襲擊？科勒·刀鋒不能容忍戰無不勝的死亡軍團接連受到打擊，他決定動用邪惡的蘭波文明的不死大軍，以及蟲族的蟑螂部隊，還有他多年來培養的克隆人軍團，對梅林扇區發動無差別攻擊。
    就在梅林扇區的聯合軍即將麵臨毀滅性打擊的時候，神秘祭司突然出現在了星辰官的隱秘藏身處。這位來無影去無蹤的偉大祭司，告訴星辰官他將是拯救梅林扇區所有文明的關鍵人物，而他身邊的四個銀河係人，將是幫助他們徹底擊敗黑暗銀河的有力武器。神秘祭司預言軒轅宇終將結束這場星係大戰，因此他的作用可能要遠高於星辰官本人。神秘祭司最後坦陳他就是當年出逃克羅諾行星的那名先知，為了使克羅諾行星免於被黑暗毀滅，他隻身一人前往銀河，探尋銀河係中的黑暗之源，希望自己掌握到控製黑暗的方法。在他離開的一萬年裏，他將精神力與黑暗結合，創造出了黑暗精神力，他發現黑暗精神力的運用要比普通精神力更流暢、更快意，而黑暗精神力的效果也遠超普通精神力的作用效果。在銀河係逗留的那段時間裏，先知發現銀河帝國的人類並沒有真正從他們征服的黑暗文明中吸取黑暗力量的真諦。由於仙女係人天生擁有操控精神力的強大天賦，很快先知就掌握了將黑暗力量與精神力結合的方法。黑暗精神力很快顯示出威力無窮的特性，先知甚至使用他的黑暗精神力消滅了銀河係中的遠古野獸。這些遠古野獸年齡比一些行星還要大，力量也十分強大，強大到一些智能文明都沒有十足的把握將它們捕獲。先知殺死了幾個遠古野獸，引來了銀河帝國的注意。為了不惹來殺身之禍，他隻好回到仙女星係，然而發現克羅諾行星已經被毀滅。為了阻止銀河帝國進一步擴張，他選擇了梅林扇區，教授這裏的仙女係人如何使用精神力進行戰鬥。
    星辰官和軒轅四兄弟對先知的經曆感到好奇和欽佩，他們希望先知能夠教授他們黑暗精神力，壯大他們的反抗力量。先知表示隻能挑選一個人作為他的親傳弟子，黑暗精神力不能流傳過廣，具有無法掌控的毀滅力量的黑暗力量，越少人掌握越好。最終，先知選擇了軒轅宇作為他的弟子，星辰官對此十分不滿，為什麼先知會選擇對精神力領域沒有天賦的銀河係人類？但他也毫無辦法，因為他不敢違抗先知的選擇。先知帶著軒轅宇暫時離開了星辰官的斥候部隊，去到了一個無人知道的地方。在若幹年後，仙女係曆史博物館中的記載裏，那個名震宇宙的黑暗大帝希爾維斯·毀滅，和他的最為信任的追隨者基洛丹·軒轅，人稱軒轅神，將再次與星辰官的幽靈軍團見麵。