時間退回到九尾妖狐被封印後的第五年。
    這天，一隊暗部剛執行完任務，在回木葉村的叢林間穿梭跳躍著。。。
    “有芥川昊一在的隊伍完成任務的難度就會降低很多啊。”（暗部甲）
    “是啊，16歲就能將芥川一族的血繼限界發揮到如此極致，真是了不起。”（暗部乙）
    “真不愧是大蛇丸的弟子啊。。。”（暗部丙）
    “前輩們過獎了，沒有你們在任務中的完美配合，我也不會那麼輕易得手的。”（昊一）
    沒錯，這個叫芥川昊一的16歲少年就是本作的男主人公。
    就在這時，一身影在叢林間閃過，昊一等人停在樹上提高了警惕。
    “別躲了，快出來！”（一暗部回身向一樹幹擲出了一支苦無）
    “哼。。。”（那人冷笑了幾聲從樹幹後站了出來）
    “大蛇丸老師！？”（昊一）
    來人正是大蛇丸。
    “是大蛇丸大人啊。。。失禮了。”（暗部甲）
    “老師怎麼會在這裏？還有。。。你好像剛戰鬥過？”（昊一）
    “啊。。。是跟自來也。。。”（大蛇丸）
    “。。。！？”（眾人驚訝）
    “為什麼會跟自來也老師交手？”（昊一）
    “昊一。。。我研究禁術的事被三代火影知道了。這本該是死罪，但三代卻放了我，這也意味著今後我不能在木葉待下去了。但是我需要你，昊一。跟我一起離開木葉吧。”（大蛇丸）
    “。。。。。。！！”（眾人）
    “為什麼要帶走芥川昊一？”（暗部乙）
    “因為他包庇我研究禁術這事要是被三代查出來，等待他的將是木葉的審判，終身監禁在牢獄中。”（大蛇丸）
    “這是真的嗎，昊一？”（暗部甲）
    昊一低頭不語。。。
    “昊一你還年輕，並且有很優秀的才能和潛質，如果失去終身的自由就太可惜了。跟我走吧，我會繼續培養你的。”（大蛇丸）
    “不可以！我們是不會允許芥川昊一離開木葉的。還有，接下來的你將會成為被木葉通緝的S級逃犯，大蛇丸。那麼，我們就在這裏將你逮捕回去吧！”（暗部甲）
    “雖然這樣說，但他可是傳說中的三忍之一，而且我們剛執行完任務，查克拉和體力已經消耗太多了。。。”（暗部甲想）
    “哼。。。現在就要逮捕我是嗎。。。或許你們可以辦得到，因為我剛和自來也戰鬥過，查克拉所剩不多了。昊一啊。。。他們要逮捕我怎麼辦？”（大蛇丸）
    “。。。。。。”昊一
    “太好了。。。如果是剛跟那位自來也大人戰鬥過的話，也許我們還有勝算。。。可不知道昊一能否對他的老師下手呢。。。他現在究竟在想什麼。。。”（暗部甲側頭看向昊一）
    昊一仍然沉默的站在那裏。
    “不管怎樣，我們還是需要增援更可靠些。”（暗部甲想）
    “你速回木葉去找增援來，這裏先由我們拖住。”（暗部甲對乙說）
    “我知道了。”（暗部乙）
    暗部乙剛一起身，昊一就手持太刀迅速擋在他的麵前，一刀將其斬殺。
    “。。。。。。！!”（其餘兩名暗部大吃一驚）
    “哼。。。看來你是想清楚了啊。昊一。。。”（大蛇丸）
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    當自來也率暗部趕到這裏時，驚呆了。另兩名暗部也倒在了血泊之中。昊一和大蛇丸不見了蹤影。。。
    回到村子後，自來也將此事告知了三代火影，三代隨即發布了通緝令“大蛇丸和芥川昊一叛逃了木葉，成為了‘S’級重犯，並下令緝拿二人”這件事在木葉發布後，很快傳到了大蛇丸的另兩名弟子奇楓諾和禦手洗紅豆的耳中，兩人都不敢相信這是真的。
    “大蛇丸老師一直在暗地裏研究禁術，而昊一一直在包庇他。。。？”（楓諾）
    “昊一怎麼會做出這樣的決定。。。”（紅豆）
    這邊，大蛇丸和昊一在叢林間穿梭跳躍著，很快就要走出了火之國境。
    “芥川一族的血繼限界。。。嗬。。。這真是我離開木葉帶走的最好實驗體啊。。。哼。。。”（大蛇丸側頭看著昊一心想，臉上露出詭異的笑容。。。）
    “昊一啊，你那暗部的麵具可以摘掉了吧。。。”（大蛇丸）
    昊一摘下了沾滿鮮血的麵具，一個俊俏的麵容露了出來。
    “老師，接下來我們去哪裏？”（昊一）
    “加入曉。”（大蛇丸）