這天（二代雷和二代火正商議和談），賀走在村子的大街上，望著藍藍的天空，長舒一口氣。自複仇計劃開始，至今都很成功，隻是希望族長不要那麼快回來。突然，賀看見一位女子走在街上，感覺有點熟悉，跑過去跟她談話。經過n時的談話，才知道她是漩渦水戶，今天出來散散心。賀邀請她一起去吃了午飯，不過一刻，一位小女孩，拉著漩渦水戶往門外走去，漩渦水戶賠笑道：“對不起，孫女太調皮了。”“沒事沒事。”賀搖搖頭。回到了現武鬥派總部（宇智波賀的家）開始管理政務，畢竟宇智波一族的內冷戰可事關重大。就在此時，一位武鬥派高層來告訴賀一戰的情況：金角銀角在和談時刺殺二代雷影與二代火影，猿飛日斬重傷逃亡，千手扉間與金角銀角死戰，生死不明。當賀聽到猿飛日斬重傷時，隻覺得眼睛一陣劇痛卻沒表現出來。好一會兒才說：“我知道了。”族人走光後，賀獨自一人來到曾經訓練的河邊，望向水中的自己。卻驚訝地發現自己的寫輪眼已經連成一個六角標星（自創，不要介意。）“這是，萬花筒寫輪眼？！”賀疑惑道。畢竟能開啟萬花筒寫輪眼的宇智波都是強者中的強者，當年斑憑著萬花筒寫輪眼與忍界之神——千手柱間打平（他還不知道又永恒萬花筒寫輪眼）可見其是多麼厲害。
    等了五天，出戰的忍者回來了，村民們喜極而泣又加悲痛欲絕地迎接忍者。賀靠著寫輪眼超高視力在茫茫人海中找到了猿飛日斬、族長、大長老和一眾宇智波族人，宇智波一族的忍者回到族中，族長驚奇地發現一些溫和派的人（原來）對他很冷漠，但他當下也無暇探討這點，他更關心的是為何可以見到一些武鬥派的人在瞎逛。大長老卻很開心，原因就不用多說了。族長回到家中，通過妻子的描述才得知，一戰期間，武鬥派政變，拉攏一大群溫和派的人，奪取了一半的政地。族長一聽，立馬血壓飆升，加上傷勢太重，最終氣死在床上。族長的兒子——金逸繼位。此時的武鬥派正在舉行派對慶祝，加上猿飛日斬繼位火影，賀更是喜上加喜。
    第二天，猿飛日斬叫賀來火影辦公室，對他說：“宇智波賀，鑒於你在大戰期間保護了村子，特邀請你加入木葉暗部，是否願意。”“如果我加入了，能否讓宇智波一族重回木葉政治中心。”日斬思考了一下，點點頭，賀當即加入暗部。與隊員見過麵，悄悄釋放萬花筒幻術控製了毫無防備的隊員。對於此行為，賀雖然很抱歉，但也要留個底。回到宇智波，正巧宇智波一族在搬家，賀露出了久違的微笑。此時的宇智波武鬥派當家，賀和大長老最得人心，也最有威信，但宇智波賀也才14、5歲的少年。因此被稱為宇智波天才少年。
    才當上暗部沒幾月，霧隱與岩隱兩村開戰，雲隱村也去湊熱鬧。岩隱向木葉請求支援，猿飛日斬礙於情麵，給予了一些忍者。賀聽到這個消息，心感不妙，可忍者已經派出去了。賀不顧大長老阻勸，毅然決定出村調查。經過一個月的時間，賀終於到了戰場。他先去了岩隱大本營，守門人一見他，還未出聲，就被賀一刀解決了。進入大本營，大野木見到賀，正準備質問，賀卻使出了加具土命，將大野木周圍的人全部抹滅。一驚，來者不善善者不來。“塵遁——原界剝離之術。”見賀實力強勁，大野木直接使出壓箱底。“虛化”賀使出萬花筒技能，避開了塵遁。“什麼  ”大野木從來沒見過這種技能，將警備拉到了最高點。
    “你究竟是誰？想幹什麼？”大野木已經慌了。“將木葉忍者還回來。”大野木一聽這話，便斷定肯定是木葉忍者。他暗暗地在背後凝聚出了塵遁，可他隻覺得背後一涼，下一秒，大野木直接倒地，身後赫然站著賀的本體，“就這實力，你太弱了。”接下來就是將木葉忍者帶回去，畢竟一戰木葉損失太嚴重了。不出一分鍾，賀就找到了派出去的50名上忍。賀命令道：“火影大人命令你們趕緊回去。”上忍們信以為真，就跟著賀回木葉了。猿飛日斬看見賀得罪了岩隱村，隻能歎氣。
    賀回到家中，大長老已經等候多時，一見麵就說：“少主，你這樣太冒險了，萬一你有個三長兩短，我怎麼對得起大人的養育之恩。”“我這不是沒事嗎？不用擔心。”賀笑了笑。此時的宇智波一族重回木葉中心，是宇智波族人的大喜事，所以在族長家中舉行了宴會，邀請族人和一些勢力高層參加。賀整理好東西，與大長老一同前去赴宴，但賀有種預感：此去有大事發生。望著宴會門口人來人往，賀暗暗驚歎：宇智波一族竟然那麼有威信力。宴會上，族長笑道：“今日我宇智波一族重回中心，日後還請各位多多關照哈。”日向一族族長開口了：“隻要將你們的重寶交出來，我就幫你們。”其他族的人紛紛應和。賀繃不住了：“你們有什麼實力，敢這樣說話。”日向族長直接開啟白眼，將查克拉凝聚於掌心，向賀飛來。賀快速結印“雷遁——雷切”與日向族長碰撞在一起。日向族長後退了幾步，端坐在位置上，賠笑道：“剛剛是在下失禮了。”其他幾族的族長也不敢說話（賀憑借萬花筒寫輪眼的增強效果才擊退日向族長）。
    賀剛坐下來，宇智波金逸（族長）提議到：“如果各位能扶持一把宇智波，我必將以重禮感謝。”“行”各位族長應和道。宴會結束後，賀前往火影辦公室，猿飛日斬見他來了，非常激動，並吩咐：“此次你要前去的地方是霧隱村，調查幾名失蹤木葉忍者的消息。”賀點點頭，帶上麵具，即刻前往水之國，霧隱村。來到霧隱村外圍，賀心想：這麼衝進去，肯定會被人發現，到時候就是襲擊了。想了半天，賀最終決定直接衝進去。附近的忍者見有人闖入村中，立馬趕了過來，可還沒等他們反應過來，就領了盒飯。“一群垃圾。”賀嘲諷道。對於霧隱的安保，賀很自信自己能進入中心地帶。“他在那。”又有一堆忍者跑來。賀一記加具土命，攔住了他們的去路，快速結印“火遁——豪火滅卻，風遁——風狂舞之術。”風借火勢，火助風威。豪火滅卻僅僅幾秒鍾，就來到了霧隱忍者麵前，將他們全部燒成灰燼。霧隱發出來一級戒備，所有忍者包括影衛全部出動。賀看著這密密麻麻的忍者，笑了笑，隨即釋放瞳術——須佐能乎，一記橫掃，將忍者刮飛一大半，忍者們嚇得停住了腳步。“宇智波。”現任水影（三代）走了出來。賀看著他，毫不猶豫地釋放了加具土命，三代水釋放水龍聚之術將其打飛。賀一驚，畢竟他還沒見過用忍術打飛瞳術的。突然，一片大霧遮住了賀的視線，無數水遁朝他飛來。賀加速結印，“火遁——豪火球之術，風遁——風亂舞之術，雷遁——雷切”幾個強力的忍術一起放了出去，與水遁在天空炸開了一朵大花。“水遁——破海龍”賀暗感不妙，原來剛剛的水遁是為了給這個忍術爭取時間。想釋放虛化又沒時間，隻能被忍術打飛。須佐消失了，賀重重地摔在地上，三代走上前，正準備一刀結果他時，卻突然口吐鮮血。原來是剛剛的戰鬥牽動了以前的舊傷複發了，賀看準時機，一發加具土命，成功將其帶走。
    霧隱忍者看水影死了，嚇得不敢動彈。矢倉首當其衝，賀也是一記加具土命將其打飛。此時，三位木葉忍者突然出現，將賀帶走。回到木葉村，日斬聽說賀殺死了三代水，非常氣憤，將賀批評了一頓。賀回到家中後，隻感覺視線模糊，眼睛劇痛。大長老看見此情況，立馬詢問發生什麼事了。講清事情的緣由後，大長老拿出一個盒子，裏麵竟然裝著一對萬花筒寫輪眼。大長老解釋道：“這是你母親留給你的。”提到母親，賀的淚水一下子就迸出來了。“隻要兩個萬花筒寫輪眼相融合，就能合成永恒萬花筒，不會失明。”雖然賀悲痛欲絕，但不願辜負母親的意願，進行了移植手術。